泛素化修飾是哺乳動物細胞中廣泛存在的一種蛋白質(zhì)翻譯后修飾，包括單泛素化修飾和不同連接方式的多泛素化修飾，在眾多的細胞過程中發(fā)揮關鍵作用，包括蛋白質(zhì)降解、細胞自噬、DNA修復、信號傳導等。其中，線性泛素化修飾參與多種免疫相關過程，如NF-kB信號通路和抗入侵病原體的選擇性自噬等。線性泛素鏈組裝復合物（LUBAC）是目前已知的唯一一個可以介導線性泛素化修飾的E3泛素連接酶復合體，由一個催化亞基HOIP和兩個調(diào)節(jié)亞基HOIL-1L和SHARPIN所組成。其中，HOIL-1L作為一個獨特的RBR類型的E3泛素連接酶，可催化相關蛋白和糖類底物的單泛素化修飾，并可調(diào)控HOIP的線性泛素化活性。LUBAC的功能異常在小鼠模型和人身上都會引起免疫系統(tǒng)紊亂，并導致多種人類免疫相關的疾病。此外，HOIL-1L的E3酶活性的缺失會導致有害的聚葡萄糖體在人體心肌和腦組織中的累積，并引起心肌病、支鏈淀粉病等疾病。中國科學院上海有機化學研究所生命有機化學國家重點實驗室的潘李鋒研究組長期致力于LUBAC的作用機制和調(diào)控機理研究。課題組前期的相關研究工作系統(tǒng)闡明了SHARPIN結(jié)合HOIP進而激活HOIP的分子機制（Cell Reports. 2017, 21(1), 27-36），并首次揭示了致病福氏志賀氏菌（S. flexneri）的E3效應蛋白IpaH1.4/2.5采用多種“伎倆”破壞LUBAC的作用機制（PNAS. 2022, 119(12), e2116776119）。

　　近期，潘李鋒研究組在Science Advances發(fā)表了題為“Mechanistic insights into the enzymatic activity of E3 ligase HOIL-1L and its regulation by the linear ubiquitin chain-binding”的研究論文（https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adi4599）。在該項研究中，該團隊首先綜合利用液體核磁共振和X射線單晶衍射技術，成功解析了HOIL-1L的催化核心區(qū)域（IBR-RING2）的晶體結(jié)構，發(fā)現(xiàn)其RING2結(jié)構域中存在一個新穎的Zn₂-Cys₆雙核簇。進一步結(jié)合相關的生化實驗，確定了HOIL-1L中非常獨特的催化三聯(lián)組，并發(fā)現(xiàn)HOIL-1L完整的RBR模塊連同NZF結(jié)構域可作為一個整體發(fā)揮其E3酶活性，介導相關蛋白和糖類底物的單泛素化修飾。同時，該團隊利用等溫量熱滴定、分析型超速離心等技術，揭示了HOIL-1L的NZF和RBR區(qū)域含有兩個不同的線性泛素二聚體的結(jié)合位點，其可協(xié)同結(jié)合線性泛素四聚體，并且該相互作用可以顯著地增強HOIL-1L的E3酶活性。隨后，利用X射線單晶衍射技術，該團隊進一步首次解析了HOIL-1L和線性泛素四聚體的復合物晶體結(jié)構，詳細闡明了HOIL-1L識別線性泛素四聚體的分子機制。同時，基于相關的結(jié)構分析、生化和細胞生物學實驗，該團隊發(fā)現(xiàn)了HOIL-1L中獨特的變構泛素結(jié)合位點，線性泛素鏈在該位點的結(jié)合會誘導變構效應，顯著促進HOIL-1L的E3酶活性，進而影響HOIP的線性泛素化活性。

　　綜上所述，該研究工作通過系統(tǒng)的生化和結(jié)構研究詳細揭示了HOIL-1L發(fā)揮E3酶活性的作用機制及其受線性泛素鏈結(jié)合調(diào)控的分子機理。據(jù)此，該團隊也對HOIL-1L在線性泛素鏈存在條件下，催化底物單泛素化修飾過程提出了一個作用模型：HOIL-1L通過其NZF-IBR區(qū)域和線性泛素四聚體發(fā)生緊密結(jié)合，其中線性泛素二聚體與變構位點的結(jié)合會引起RING1區(qū)域的構象變化，進而促進HOIL-1L與E2~Ub的結(jié)合；同時，IBR-RING2區(qū)域接近E2~Ub中間體，完成Ub在E2和HOIL-1L之間的傳遞；最后，HOIL-1L~Ub中間體與底物相互作用進而完成底物的單泛素化修飾?？傊?，該研究工作從結(jié)構角度對HOIL-1L的催化機制及其受線性泛素鏈結(jié)合調(diào)控的分子機理提供了新見解，擴展了領域內(nèi)對RBR類型E3泛素連接酶的催化機制的認識。　　

　　圖2. 線性泛素鏈結(jié)合促進HOIL-1L的E3酶活性的作用模型圖

　　潘李鋒課題組已畢業(yè)的博士生許曉龍和博士后王亞茹為本文的共同第一作者。上述研究工作得到上海蛋白質(zhì)中心的彭超博士團隊在質(zhì)譜分析方面的大力支持，同時獲得了國家自然科學基金委、科技部國家重點研發(fā)專項項目、上海市科委、中國科學院和生命有機化學國家重點實驗室的資助。

圖1. HOIL-1L發(fā)揮E3酶活性以及結(jié)合線性泛素四聚體的分子機制