加快打造原始創(chuàng)新策源地,加快突破關(guān)鍵核心技術(shù),努力搶占科技制高點,為把我國建設(shè)成為世界科技強國作出新的更大的貢獻。

——習近平總書記在致中國科學院建院70周年賀信中作出的“兩加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿、面向經(jīng)濟主戰(zhàn)場、面向國家重大需求、面向人民生命健康,率先實現(xiàn)科學技術(shù)跨越發(fā)展,率先建成國家創(chuàng)新人才高地,率先建成國家高水平科技智庫,率先建設(shè)國際一流科研機構(gòu)。

——中國科學院辦院方針

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趙國屏:合成生物學:生命科學的“利器”

發(fā)布時間:2020-12-01 【字體: 】【打印】 【關(guān)閉

  人類進入21世紀以來,一門新興的交叉學科“合成生物學”成為國際科學前沿一大熱門。

  合成生物學,能利用大腸桿菌生產(chǎn)大宗化工材料,擺脫石油原料的束縛;酵母菌生產(chǎn)青蒿酸和稀有人參皂苷,降低成本,促進新藥研發(fā);工程菌不“誤傷”正常細胞,專一攻擊癌細胞;創(chuàng)制載有人工基因組的“人造細胞”,探究生命進化之路;利用DNA儲存數(shù)據(jù)信息并開發(fā)生物計算機……作為科學界的新生力量,合成生物學進展迅速,并已在化工、能源、材料、農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥、環(huán)境和健康等領(lǐng)域展現(xiàn)出廣闊的應用前景。

  探究生命起源演化  解讀“密碼”改造自然 

  生命是世界上最復雜的物質(zhì)存在。人類自誕生以來,就在認識生命的漫漫長途中上下求索。從中國古代的《黃帝內(nèi)經(jīng)》和《本草綱目》,到西方近代博物學家對動植物分類,人類對于生命現(xiàn)象的認識,都是從對生命體的“宏觀”觀察、“表觀”描述而獲得的經(jīng)驗型邏輯總結(jié)。另一方面,對于譬如尿素之類的“有機物”,化學家們也認為只能由生物體在一種神秘的“生命力”作用下產(chǎn)生。

  1828年,德國化學家弗里德里?!ぞS勒無意在無機實驗中合成了尿素,揭開了人工合成有機物的“合成化學”序幕。也就是從19世紀后期到20世紀前半葉,基于數(shù)理化技術(shù)與方法的實驗科學催生了認識生命共同本質(zhì)的細胞生物學、生物化學、遺傳學和發(fā)育生物學,而進化論的誕生,則最先將人類對生命的認識,提升到了理論的高度。

  20世紀中葉,隨著DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的發(fā)現(xiàn),分子生物學“中心法則”的確立,人類開始找到生命現(xiàn)象的“密碼本”。而生命另一類基本分子,具有生理活性的蛋白質(zhì)牛胰島素一級結(jié)構(gòu)的解析,直接導致了我國科學家于60年代完成其全人工合成,即世界上首次人工合成蛋白質(zhì)。在同一時代,DNA測序技術(shù)的建立,實現(xiàn)了人類“讀基因”的夢想;DNA重組技術(shù)的建立,實現(xiàn)了人類“寫基因”的夢想;再加上在基因定向突變與敲除基礎(chǔ)上的“編基因”夢想的實現(xiàn),分子生物學及基因工程技術(shù)在上世紀80年代,將生命科學推向了歷史上第一次革命的頂峰。

  至20世紀末,人類基因組計劃帶來了第二次革命,實現(xiàn)了基因組的全面“解讀”,人類對生物體組成和生命規(guī)律的認識達到了前所未有的系統(tǒng)生物學的深度和定量生物學的精度。2010年,科學家合成約100萬堿基的支原體基因組,并將其轉(zhuǎn)入另一種支原體細胞中,獲得可正常生長和分裂的“人造生命”,實現(xiàn)了“撰寫”基因組的夢想。此后,科學家又合成了非天然核苷酸、非天然氨基酸;并采用“編輯”基因組的手段,創(chuàng)建出人造單染色體真核細胞……人類掌握了“讀”“寫”“編”基因組的技術(shù)手段,獲得了設(shè)計與合成生命的能力,200年前盛行于世的“生命力”學說被完全克服。

   什么是合成生物學?

  有什么樣的認識(科學)和手段(技術(shù))就有什么樣的工程。古代,通過“嘗百草”檢驗植物藥性,建立中藥體系,通過人工馴化與優(yōu)選,獲取種質(zhì)資源,建立畜牧業(yè)與農(nóng)業(yè)體系,都是利用當時的生物認識和生物技術(shù),造福人類的典型工程實踐。今天,怎樣利用對生命“密碼本”的認識及對其“編寫”的手段,改造自然、造福人類?21世紀初, 科學家們將工程科學的研究理念融入現(xiàn)代生命科學,發(fā)展出以合成生物學為代表的“會聚”研究,促成了生命科學的第三次革命。

  合成生物學采用工程學“自下而上”的理念,打破“自然”和“非自然”的界限,從系統(tǒng)表征自然界具有催化調(diào)控等功能的生物大分子,使其成為標準化“元件”,到創(chuàng)建“模塊”“線路”等全新生物部件與細胞“底盤”,構(gòu)建有各類用途的人造生命系統(tǒng)。這一與系統(tǒng)生物學“自上而下”解析理念相反的合成理念,也將我們習以為常的“格物致知”研究策略,推進到了“建物致知”的新高度。這樣,進化過程中“猜測”的祖先物種或分子體系,將可能被合成,并加以定向的詮釋;而被各種“假說”“對照”分割研究的復雜生命現(xiàn)象,也可以實現(xiàn)整合的定量研究,解析因果機制。

  合成生物學采用工程學“設(shè)計—合成—測試”的研究方法,在學習抽象自然生命系統(tǒng)的基礎(chǔ)上,或?qū)ψ匀簧锵到y(tǒng)“重編程”,或重頭設(shè)計具有全新特征的人工生命體系;然后,利用“基因編輯”“基因合成”等“工具包”,用實驗方法來構(gòu)建,再對構(gòu)建出來的生物系統(tǒng)進行測試,如此反復循環(huán)優(yōu)化,形成了一個正向可靠的科學閉環(huán)。建筑在如此大規(guī)模通用化工程平臺基礎(chǔ)上的合成生物學,往往也被稱為“工程生物學”,它“建物致用”的工程能力,有望為解決健康、能源、糧食、環(huán)境等重大問題做出新貢獻。

   破解資源環(huán)境難題 賦能人類健康事業(yè) 

  當前,資源短缺、環(huán)境污染、氣候變化等全球問題日益凸顯,合成生物技術(shù)為實現(xiàn)“社會—生態(tài)/環(huán)境—經(jīng)濟”和諧發(fā)展提供了全新解決方案。

  石油是儲量有限的不可再生資源,遲早有枯竭的一天,這是人類生存發(fā)展必須嚴肅應對的問題。在理論上,絕大多數(shù)石油化學品都能夠借助合成生物學技術(shù)制得,人們還可通過生物合成技術(shù)制造出傳統(tǒng)化工無法合成的新燃料。同時,合成生物學在人工固碳、利用二氧化碳方面取得進展。例如,科學家通過對細菌進行人工優(yōu)化和改造,建造可將大氣中的二氧化碳轉(zhuǎn)化為酮、醇、酸等化學品的“細胞工廠”,實現(xiàn)二氧化碳等資源的高效綜合利用,推動建立低能耗、低污染、低排放的低碳經(jīng)濟模式。

  隨著全球人口不斷增長,環(huán)境污染加劇和氣候持續(xù)變化,人類食品和環(huán)境安全面臨巨大挑戰(zhàn)。利用合成生物學技術(shù),創(chuàng)建適用于食品工業(yè)的細胞工廠,將可再生原料轉(zhuǎn)化為重要食品組分,這被認為是解決食品問題的可行途徑。在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中,氮肥使用量大幅增加帶來的土壤板結(jié)和酸化等問題,可以通過合成生物學“微生物固氮”技術(shù)得以有效解決。在環(huán)境治理領(lǐng)域,可以通過“定制”微生物去除難降解的有機污染物,也可開發(fā)出人工合成的微生物傳感器,幫助人類監(jiān)測環(huán)境,設(shè)計構(gòu)建能夠識別和富集土壤或水中的鎘、汞、砷等重金屬污染物的微生物,以大幅提升污染治理效能。

  合成生物學在生命健康領(lǐng)域也有廣闊的用途,不僅能夠用于天然產(chǎn)物等醫(yī)藥產(chǎn)品的生產(chǎn),還能在疾病研究模型的開發(fā)、生物標志物監(jiān)測、干細胞與再生醫(yī)學等領(lǐng)域發(fā)揮巨大作用。例如,人體腸道內(nèi)具有豐富多樣的微生物,合成生物學為腸道微生物的改造提供了工具:一方面,可以設(shè)計改造對人體有益的細菌,讓它們生產(chǎn)人體自身不能合成的維生素等營養(yǎng)物質(zhì);另一方面,可以設(shè)計出感知腸道環(huán)境變化的“智能微生物”,對人體內(nèi)的健康狀態(tài)進行檢測和診斷。

  在抗擊新冠肺炎疫情中,合成生物學技術(shù)發(fā)揮了重要作用,展現(xiàn)了強大應用潛力。例如,利用DNA條形碼技術(shù)改進測序流程、利用基因編輯技術(shù)開發(fā)核酸診斷試劑,提高診斷的準確性和靈敏度。利用合成生物學技術(shù)還可以尋找潛在的小分子藥物、開發(fā)疫苗,以及通過調(diào)節(jié)人體微生物組來激活人體免疫系統(tǒng),提高人體抗病毒能力。

  改造生命的目的,是為了更好地認識和調(diào)控生命現(xiàn)象,使之為改善生態(tài)、提高人類生命生活質(zhì)量服務。未來,在人工智能和大數(shù)據(jù)等新技術(shù)推動下,合成生物學將賦予人類更強的“改造自然,利用自然”的能力,當然,同時也會帶來社會倫理與安全等新問題。我們必須在思想上明確該做什么,怎么做才是正確的;在做好風險評估并開發(fā)防控風險的技術(shù)和策略的同時,及時制定相應的研究規(guī)范、倫理指導原則和相應的法律、法規(guī),并輔以可落實的管理規(guī)章與監(jiān)管辦法。

  人類數(shù)百萬年對于生命的探索,經(jīng)過最近兩個多世紀的三次革命,才達到了“合成生物學”的高度,形成了工程化的能力。然而,這只是“萬里長征第一步”。用好合成生物學的“利器”,為實現(xiàn)建設(shè)社會主義現(xiàn)代化強國的理想作出貢獻,還需要投入大量心血,提升知識、創(chuàng)新技術(shù)、踏實轉(zhuǎn)化、服務需求。中國科學工作者對此責無旁貸。

 ?。ㄗ髡邽橹袊茖W院院士、中國科學院合成生物學重點實驗室專家委員會主任)