2024年9月6日，中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所譚敏佳課題組、中科中山藥物創(chuàng)新研究院徐駿宇課題組，聯(lián)合中國(guó)科學(xué)院營(yíng)養(yǎng)與健康研究所秦駿課題組、上海交通大學(xué)附屬仁濟(jì)醫(yī)院薛蔚/董柏君團(tuán)隊(duì)、上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院李婧課題組于Nature子刊Nature Cancer發(fā)表題為 “Integrative proteogenomic profiling of high-risk prostate cancer samples from Chinese patients indicates metabolic vulnerabilities and diagnostic biomarkers” 的研究論文，綜合基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組和磷酸蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)，揭示了基因組和轉(zhuǎn)錄組分析未完全闡明的前列腺癌分子機(jī)制和疾病亞型，加深了人們對(duì)前列腺癌臨床特征的生物學(xué)理解。

前列腺癌（PCa）呈現(xiàn)出東西方人群基因組層面的差異性，這反映在癌癥基因組和疾病進(jìn)展的不同變化中。在本項(xiàng)工作中，研究人員針對(duì)125例癌和癌旁配對(duì)的臨床原位高危前列腺癌樣本進(jìn)行了蛋白基因組學(xué)的全景解析，以增強(qiáng)對(duì)于高危前列腺癌預(yù)后，診斷和治療的理解。為了實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)，研究人員將研究重點(diǎn)放在揭示不同預(yù)后特征的分子亞型，揭示關(guān)鍵的致癌磷酸化事件，以及探索精準(zhǔn)診斷和預(yù)后的生物標(biāo)志物上。基于蛋白質(zhì)組學(xué)的分子分型，研究人員發(fā)現(xiàn)預(yù)后最差的S-III亞型中代謝信號(hào)和癌癥通路則更加顯著地被激活。進(jìn)一步的機(jī)制解析發(fā)現(xiàn)，支鏈氨基酸代謝途徑關(guān)鍵酶BCAT2的高表達(dá)提高了癌組織對(duì)于支鏈氨基酸的利用，促進(jìn)了前列腺癌的增殖?；诹姿峄M學(xué)的全景分析，研究人員確定了FOXA1-S331磷酸化修飾能促進(jìn)下游AR信號(hào)通路的活化過(guò)程，而抑制FOXA1-S331磷酸化修飾水平則能夠減緩前列腺癌的進(jìn)展過(guò)程。此外，基于蛋白質(zhì)組學(xué)和臨床數(shù)據(jù)的整合分析，研究人員發(fā)現(xiàn)GOLM1可以作為一種潛在生物標(biāo)志物，用于診斷PSA（前列腺癌特異性抗原）“灰區(qū)”的前列腺癌患者。研究表明，在PSA灰區(qū)，血清GOLM1具有更高的特異性和靈敏度。

中國(guó)人群前列腺癌整合的蛋白質(zhì)組學(xué)分子圖譜全景

上海交通大學(xué)附屬仁濟(jì)醫(yī)院董柏君主任醫(yī)師，中科中山藥物創(chuàng)新研究院徐駿宇研究員，上海藥物所博士研究生黃玉琦，營(yíng)養(yǎng)與健康所博士研究生郭佳成，上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院博士研究生董群以及上海交通大學(xué)附屬仁濟(jì)醫(yī)院王艷青主治醫(yī)師為本文共同第一作者。

營(yíng)養(yǎng)與健康所秦駿研究員、上海藥物所譚敏佳研究員、中科中山藥物創(chuàng)新研究院徐駿宇研究員、上海交通大學(xué)附屬仁濟(jì)醫(yī)院薛蔚主任、上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院李婧教授為本文通訊作者。陸軍軍醫(yī)大學(xué)附屬大坪醫(yī)院劉秋禮和上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院張健教授為本研究提供了大力支持和幫助。該研究工作得到了國(guó)家自然科學(xué)基金委等項(xiàng)目的資助。

原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s43018-024-00820-2