上海有機(jī)所推出可在線預(yù)測19F NMR化學(xué)位移的含氟試劑數(shù)據(jù)庫FluoBase

文章來源:上海有機(jī)化學(xué)研究所  |  發(fā)布時間:2024-04-01  |  【打印】 【關(guān)閉

  

有機(jī)氟化合物由于其獨(dú)特的理化和生物性能,在醫(yī)藥、農(nóng)藥、先進(jìn)材料等領(lǐng)域發(fā)揮著不可替代的作用。含氟試劑是發(fā)展有機(jī)氟化合物合成方法的基礎(chǔ),是氟化學(xué)領(lǐng)域發(fā)展的基石。然而,含氟試劑的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)、功能等信息分散于浩瀚的文獻(xiàn)中,不便于合成化學(xué)家的查找和使用。因此需要一個專業(yè)的平臺來全面了解和積累其結(jié)構(gòu)、性質(zhì)、功能等核心信息。近日,中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所薛小松課題組推出了FluoBase——含氟試劑數(shù)據(jù)庫,為研究人員、教育工作者和行業(yè)專業(yè)人士提供專業(yè)、可靠、時新和豐富的含氟化試劑相關(guān)的信息。

氟基地FluoBase首頁

FluoBase目前已收錄1500多種含氟試劑,涵蓋5000多條物化性質(zhì)(包含密度、熔點(diǎn)、沸點(diǎn)、溶解度、穩(wěn)定性,氧化還原電位、親核性、親電性、鍵解離能等),600多個三維結(jié)構(gòu),120多條晶體信息。數(shù)據(jù)庫提供了根據(jù)試劑類型分類瀏覽及根據(jù)結(jié)構(gòu)或關(guān)鍵詞檢索兩種模式,在檢索預(yù)覽界面,可以根據(jù)試劑的類型(親電、親核,自由基)或部分性質(zhì)(如氧化還原電位,鍵能)進(jìn)行篩選。

FluoBase不僅包含豐富的試劑信息,還納入了機(jī)器學(xué)習(xí)模型。研究人員收集了3376個不重復(fù)的19F NMR化學(xué)位移,使用圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)實(shí)現(xiàn)了19F NMR化學(xué)位移的精準(zhǔn)預(yù)測。通過FluoBase中的FNMR預(yù)測頁面https://fluobase.siochemdb.com/fnmr),可以有效地快速在線預(yù)測各種有機(jī)氟化合物的19F NMR化學(xué)位移。

FluoBase中的FNMR預(yù)測頁面

FluoBase今后還計(jì)劃收錄其它重要含氟功能分子,比如含氟藥物,制冷劑、麻醉劑等。

感謝國家自然科學(xué)基金委、科技部、中國科學(xué)院,國家智能化學(xué)數(shù)據(jù)中心和上海有機(jī)化學(xué)研究所的大力資助!特別感謝上海有機(jī)化學(xué)研究所科研處楊慧娜處長,先進(jìn)氟氮材料重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(中國科學(xué)院)殷亮研究員、趙延川研究員、倪傳法研究員等老師以及黃廣龍、朱凱帝等同學(xué)們在數(shù)據(jù)庫建設(shè)中給予的大力支持和寶貴建議。

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