中國科學(xué)院腦智卓越中心和自動化所合作研發(fā)出大數(shù)據(jù)流實時處理系統(tǒng),實現(xiàn)全腦光學(xué)接口虛擬現(xiàn)實和全腦閉環(huán)研究新范式

文章來源:腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心  |  發(fā)布時間:2024-03-11  |  【打印】 【關(guān)閉

  

2024年3月11日,《自然·神經(jīng)科學(xué)》在線發(fā)表了題為《實時分析大規(guī)模神經(jīng)成像,實現(xiàn)神經(jīng)動態(tài)的閉環(huán)研究》的論文,報道了中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越中心杜久林研究組、穆宇研究組和自動化研究所蒿杰研究組的合作研究。研究成果已授權(quán)發(fā)明專利“光學(xué)腦機接口系統(tǒng)和方法”(專利號:ZL202310131178.9)。

該研究借助天文學(xué)領(lǐng)域的數(shù)據(jù)處理技術(shù),采用FPGA-GPU混合架構(gòu),成功對高達500MB/s的大數(shù)據(jù)流神經(jīng)功能數(shù)據(jù)進行實時配準、信號提取和分析。通過這一技術(shù)突破,研究團隊首次實現(xiàn)了對斑馬魚全腦十萬級神經(jīng)元的實時監(jiān)控與分析,進而對任意選擇的神經(jīng)元集群活動進行解碼,以控制外部設(shè)備。這一成果標志著基于全腦單細胞光學(xué)成像的虛擬現(xiàn)實、光遺傳調(diào)控等技術(shù)在腦科學(xué)閉環(huán)研究中的應(yīng)用邁出了關(guān)鍵一步。

全腦單神經(jīng)元活動成像是解析大腦并行分布式計算原理的有力工具,但其巨大的數(shù)據(jù)處理需求成為了難以逾越的技術(shù)瓶頸,導(dǎo)致難以實時分析以及在大尺度上閉環(huán)調(diào)控和研究腦功能。啟發(fā)于天文學(xué)領(lǐng)域中快速射電暴檢測技術(shù),研究人員借鑒其FX系統(tǒng)設(shè)計策略,利用FPGA編程的靈活性建立光學(xué)神經(jīng)信號預(yù)處理系統(tǒng),對來自光學(xué)傳感器的信號規(guī)整化,并將其發(fā)送給基于GPU的實時處理系統(tǒng),進行高速非線性配準,提取各信道的神經(jīng)信號,依據(jù)編碼規(guī)則進行解碼,以獲得用于控制外部器件的反饋信號。該系統(tǒng)通過實時監(jiān)測斑馬魚全腦神經(jīng)元的活動,生成反饋信號,反饋間隔小于70.5毫秒。

系統(tǒng)性能在三個腦科學(xué)閉環(huán)研究場景下進行了展示:與任意特定神經(jīng)元集群活動鎖相的實時光遺傳學(xué)刺激,與特定大腦功能狀態(tài)鎖相的實時視覺刺激,以及基于神經(jīng)元集群活動的虛擬現(xiàn)實控制。

閉環(huán)實時光遺傳學(xué)神經(jīng)調(diào)控:通過功能聚類識別全腦神經(jīng)元集群,將選定集群的自發(fā)活動作為觸發(fā)信號,實時實施光遺傳學(xué)刺激于目標神經(jīng)元集群。相對于開環(huán),閉環(huán)刺激有效激活了下游腦區(qū)。

鎖相的實時視覺刺激實驗:通過對藍斑去甲腎上腺素能系統(tǒng)活動的實時監(jiān)測,在表征動物清醒狀態(tài)的藍斑興奮時相上施加視覺刺激,觀察到大腦中其他神經(jīng)元的反應(yīng)更為強烈。這表明,大腦狀態(tài)可調(diào)節(jié)對視覺信息的處理,同時指出閉環(huán)感覺刺激有助于精確研究大腦內(nèi)部狀態(tài)與外界環(huán)境的相互作用。

全腦光學(xué)腦機接口實現(xiàn)的虛擬現(xiàn)實:實時將高維的全腦所有神經(jīng)元活動降維到多個神經(jīng)元集群的活動,并將任一集群的活動與視覺環(huán)境閉環(huán)聯(lián)接,建立了基于光學(xué)成像、直接從腦神經(jīng)元活動到視覺環(huán)境的虛擬現(xiàn)實系統(tǒng)。在該虛擬現(xiàn)實中,可以隨意調(diào)整神經(jīng)活動與環(huán)境耦合的增益,使控制環(huán)境的神經(jīng)元集群根據(jù)增益變化適應(yīng)性地調(diào)整其活動輸出。依托大數(shù)據(jù)流的實時分析和高通量全腦成像技術(shù),未來研究將篩選適合光學(xué)腦機接口的神經(jīng)群體活動特征,揭示其機制,并開發(fā)出更高效的光學(xué)腦機接口技術(shù)。

中國科學(xué)院腦智卓越中心杜久林研究員、自動化所蒿杰研究員、腦智中心卓越穆宇研究員為共同通訊作者;暨南大學(xué)/深圳市神經(jīng)科學(xué)研究院尚春峰研究員(原杜久林研究組副研究員)、腦智卓越中心汪玙璠博士、自動化所趙美婷助理研究員為共同第一作者;自動化所范秋香助理研究員、腦智卓越中心趙姍博士生、錢禹工程師和徐圣進研究員做出了重要貢獻。該工作得到科技部、基金委、中國科學(xué)院、上海市和深圳市的資助。

圖注:左圖展現(xiàn)這一創(chuàng)新系統(tǒng)如何巧妙地將內(nèi)在世界的神經(jīng)活動與外部現(xiàn)實世界連接起來的迷人之處。右圖展示利用該系統(tǒng)實施的光學(xué)腦機接口技術(shù),通過大腦內(nèi)部神經(jīng)元集群的活動實現(xiàn)虛擬現(xiàn)實控制。