分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心揭示人線粒體tRNA t6A修飾對線粒體基因表達(dá)調(diào)控的多重作用

文章來源:分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心  |  發(fā)布時間:2024-01-17  |  【打印】 【關(guān)閉

  

  1月16日,國際學(xué)術(shù)期刊Nucleic Acids Research在線發(fā)表了中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所)周小龍研究組與王恩多研究組的最新合作研究成果“Multifaceted roles of t6A biogenesis in efficiency and fidelity of mitochondrial gene expression”。該項工作揭示了人線粒體tRNA N6-蘇氨?;紫佘账幔╰6A)修飾對線粒體基因表達(dá)調(diào)控的多重作用。

  轉(zhuǎn)移核糖核酸(tRNA)在細(xì)胞內(nèi)所有核酸分子中含有最多的轉(zhuǎn)錄后修飾,這些化學(xué)修飾對于穩(wěn)定tRNA的結(jié)構(gòu)和功能十分重要。其中,t6A修飾高度保守,僅發(fā)生在解碼ANN(N = A, T, G, C)密碼子的tRNA的37位腺嘌呤(t6A37)上。人線粒體tRNA t6A37修飾由YRDC與OSGEPL1 共同催化完成。研究組前期工作已經(jīng)闡釋OSGEPL1催化t6A37修飾的生化基礎(chǔ),但t6A37修飾在哺乳動物線粒體mRNA翻譯過程中發(fā)揮的功能尚不清楚。

  在該項研究中,研究人員通過CRISPR-Cas9技術(shù)在HEK293T細(xì)胞上構(gòu)建了敲除OSGEPL1基因的KO細(xì)胞系,發(fā)現(xiàn)t6A37修飾的缺失會專一地上調(diào)線粒體tRNAThr和tRNALys上第9位N1-甲基腺嘌呤(m1A9)和第10位N2-甲基鳥嘌呤(m2G10)修飾;此外,缺失t6A37修飾也會專一地下調(diào)線粒體tRNAThr和tRNALys的氨基?;?。通過分離線粒體氧化磷酸化超復(fù)合物并進(jìn)行蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析,研究人員發(fā)現(xiàn)t6A37修飾的缺失會使臨近的U36不僅與mRNA上密碼子的第1位A配對,還錯誤識別密碼子第一位的其他非對應(yīng)核苷酸(G/C/U),導(dǎo)致多種線粒體遺傳密碼被錯誤解碼。線粒體翻譯效率及保真性的下降導(dǎo)致線粒體氧化磷酸化復(fù)合物含量及活力下降,并進(jìn)一步導(dǎo)致線粒體結(jié)構(gòu)及功能的異常、激活線粒體非折疊蛋白質(zhì)反應(yīng)(UPRmt)。研究人員進(jìn)一步構(gòu)建了Osgepl1全身敲除的小鼠并重點研究了該小鼠的心臟功能。發(fā)現(xiàn)Osgepl1-KO小鼠心臟線粒體編碼的Mt-Cox2和Mt-Cox3的表達(dá)量顯著下降,但這一變化還不足以影響心臟線粒體氧化磷酸化復(fù)合物的組裝,也沒有對Osgepl1-KO小鼠的心臟功能及壽命產(chǎn)生明顯影響。

  該研究首次發(fā)現(xiàn)線粒體tRNA t6A37修飾與m1A9,m2G10修飾的協(xié)同調(diào)控;系統(tǒng)揭示t6A37修飾對線粒體tRNA氨基?;降挠绊?;闡明線粒體tRNA t6A37修飾缺失影響線粒體密碼子解碼保真性失調(diào)的機(jī)制。以上結(jié)果加深了人們對線粒體tRNA修飾的生物學(xué)功能的認(rèn)識。

  分子細(xì)胞卓越中心博士研究生張勇與周敬波為該文共同第一作者,周小龍研究員與王恩多研究員為該文共同通訊作者。國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心(上海)殷躍博士參與了該研究。感謝分子細(xì)胞卓越中心分子生物學(xué)技術(shù)平臺的大力支持。該研究得到了科技部、國家自然科學(xué)基金委、中國科學(xué)院、上海市科委的經(jīng)費資助。

  文章鏈接:https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkae013/7560177

線粒體tRNA t6A修飾對線粒體基因表達(dá)調(diào)控的多重作用